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70歲林先生，因脊椎受傷住院，住院期間因發燒疑似感染使用抗生素，在感染獲得控制後，卻產生嚴重腹瀉的情形，經糞便檢驗及大腸鏡檢查，證實為困難梭狀桿菌感染併發偽膜性大腸炎，在經過二線抗生素治療，腹瀉問題仍然存在，並且多次因嚴重腹瀉導致虛脫而造成呼吸衰竭，多次住進加護病房並且需仰賴呼吸器維持呼吸功能。後來取用林先生女兒檢驗合格之糞便為病人進行「糞便微菌叢移植」手術，已順利出院，且無復發的情形。亞東醫院肝膽胃腸科陳冠至表示，引起病人嚴重腹瀉的「困難梭狀桿菌」，是一種革蘭氏陽性、會產生內孢子的人類致病菌，其感染途徑是透過糞口傳染，感染個案通常是接觸到被困難梭狀桿菌汙染的環境，而後再由口食入。正常腸道具有平衡的腸道微生物菌叢多元性，而當腸道微生物菌叢多元性遭受破壞而降低時(通常是因為使用抗生素)，再加上困難梭狀桿菌食入體內，就有機會在腸道內伺機繁衍，造成偽膜性大腸炎，通常會有嚴重的腹瀉，好發族群為：使用抗生素，醫療機構住民，以及大於65歲以上的老人。困難梭狀桿菌造成的腹瀉，容易復發且嚴重可能導致死亡，當復發性或嚴重感染時，經常規治療方式無效時，可以考慮用糞便微菌叢移植來進行治療，其治療原理是藉由移植健康者的糞便到患者腸道內，以重建腸道微生物菌叢的多元性，進一步使得困難梭狀桿菌無法生存，讓腸道黏膜回到健康狀態，達到治療的目的。糞便微菌叢移植，目前僅可用在復發性或嚴重性困難梭狀芽孢桿菌感染，經常規治療無效之患者，同時國內專家學者也已擬定相關法規，規範糞便微菌叢移植，讓「神奇的糞便」可以安全又有效地救治更多需要的人。未來糞便微菌叢移植，可能還可以應用在發炎性腸道疾病、大腸激躁症、肥胖、新陳代謝症候群及巴金森氏症等疾病，有待進一步研究證實療效。